le vivant discret et continu ; modes de représentation en biologie théorique

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À propos




Extrait
Introduction
Nicolas Glade & Angélique Stéphanou
Le vivant discret et continu : dualité et complémentarité des modes de représentation en biologie théorique
Chapitre 1
Jacques Demongeot
Des biomathématiques pour modéliser le vivant
1] Introduction : panorama général des biomathématiques
2] Des biomathématiques discrètes pour modéliser le vivant
3] Des biomathématiques continues pour modéliser le vivant
4] Perspectives
5] Conclusion
Chapitre 2
Samuel Bernard
Modélisation multi-échelles en biologie
1] Introduction
2] Du monoéchelle au multi-échelles en biologie
3] Modèles basés sur les équations maîtresses
4] Modélisation individu-centré
5] Modèles hybrides continus-discrets
6] Modèles EDP structurés
7] Conclusion et discussion
Chapitre 3
Vitaly Volpert, Nikolay Bessonov, Nathalie Eymard, Alen Tosenberger
Modèle multi-échelle de la dynamique cellulaire
1] Introduction
/> 2] Régulation intracellulaire et extracellulaire
3] Mouvement du milieu
4] Modèle multi-échelle
5] Applications
6] Discussion
Chapitre 4
Arnaud Chauvière, Haralampos Hatzikirou, Marco Tektonidis & Andreas Deutsch
Introduction aux automates cellulaires de type « latticegas ». Application à la croissance in vitro des gliomes et à l’identification de leurs mécanismes d’invasion
1] Introduction et objectifs du cours
2] Généralités sur les automates cellulaires de type « lattice-gas »
3] Modélisation de la croissance in vitro des gliomes
Chapitre 5
Emmanuel Promayon
Modéliser les cellules comme des objets déformables 3D couplant biomécanique et chimie
1] Introduction
2] Modélisation
3] Simulations
4] Conclusion
Chapitre 6
Pascal Ballet, Alain Pothet, Gradimir Misevic, Anne Jeannin-Girardon, Alexandra Fronville, Vincent Rodin
Une approche multi-agent pour la simulation en biologie cellulaire
1] Introduction
2] Historique
3] Le défit de l’interdisciplinarité
4] Modèle informatique
5] Exemples d’application
6] Enseignement et simulation individu-centré
7] Conclusion
Chapitre 7
Julien Berro
Approches individus-centrées pour l’étude du cytosquelette
1] Introduction
2] Le cytosquelette est un auto-assemblage de biopolymères
3] Dynamique des filaments isolés
4] Organisation collective de filaments et production de forces
5] Organisation de structures intracellulaires
6] Conclusion
Chapitre 8
Stéphanie Portet
Assemblage in vitro des filaments intermédiaires
1] Introduction
2] Méthode
3] Résultats
4] Conclusion
5] Annexe : Dérivations des ki,j
Chapitre 9
Hugues Berry
Modélisation de la diffusion-réaction dans les milieux intracellulaires encombrés
1] Le mouvement passif des macromolécules dans la cellule
2] Modéliser la sous-diffusion anormale
3] Conclusion : Sous-diffusion discrète, continue voire hybride
Chapitre 10
Patrick Amar
Étude comparée de quelques méthodes de simulation de réactions biochimiques
1] Modélisation continue à équations différentielles
2] Modélisation discrète
3] Le simulateur HSIM
4] Oscillations et horloges biologiques
Chapitre 11
S. Randall Thomas
Modélisation en physiologie
1] Introduction
2] Principes de base de biophysique et de thermodynamique
3] Régulation à long terme de la pression artérielle : modèles physiologiques multi-organe, multi-échelle
4] Fonction rénale et homéostasie
5] Annexe
Chapitre 12
Pierre Baconnier
Fractales, chaos et complexité en physiologie. À propos de la physiologie de la respiration chez les mammifères
Préambule
1] Introduction
2] Morphologie de l’arbre trachéo-bronchique et géométrie fractale
3] Oscillateurs respiratoires et chaos
4] Systèmes complexes et physiologie
Conclusion
Chapitre 13
Éric Fanchon
La vie, les machines, l’information et les systèmes dynamiques
1] Introduction : The language of God et The Book of Life…
2] Gènes, séquences, information génétique
3] Concept d’information, théorie de l’information
4] Schrödinger : stochasticité et ordre biologique
5] Notion de programme et déterminisme génétique
6] Complexité et mesures de complexité
7] Le vivant et la machine
8] La fonction biologique
9] Modéliser la dynamique des systèmes vivants
Chapitre 14
Sylvain Lespinats
Le fléau de la dimension en biologie théorique
1] Les métriques
2] Dimension de l’espace et dimension intrinsèque des données
3] Le fléau de la dimension
4] Réduction de la dimension et analyse visuelle des données
Auteurs & résumés/abstracts

Rayons : Sciences & Techniques > Sciences de la vie

  • EAN

    9782919694235

  • Disponibilité

    Disponible

  • Nombre de pages

    428 Pages

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